Di samping kegiatan pengajaran dan pengabdian masyarakat, School of Applied STEM Universitas Prasetiya Mulya juga menyelenggarakan kegiatan-kegiatan penelitian kolaboratif yang dikerjakan oleh beberapa grup riset, antara lain:

Agricultural Insurance Analysis

Algae Biorefinery

Bioresource Processing

Computational Fluid Dynamics

Food Bioprocessing

Healthy Foods

Human Welfare Technology

Industrial Optimization

STEM Education